依「各單位永久保存檔案移交國立屏東大學檔案室徵集計畫」，辦理多次檔案徵集，以逐步完善本校檔案資料。

合校檔案徵集

  徵集合校前各單位需永久保存檔案，包括主計室、事務組及秘書室等3個單位，共171件。

學籍檔案徵集

徵集民國35年-45年學籍檔案共41件

校史檔案徵集(跨機關、跨校徵集)

因本校前身為臺灣省立臺南師範學校屏東分校，為完善本校校史檔案資料，分別向國立台南大學及國家檔案管理局徵集民國38年以前校史檔案資料共計25件